收割机本身的设计和维护不当可能是导致脱粒不尽的主要原因之一。收割机脱粒部分的设计是否合理，是否能够充分将农作物的籽粒从秆杆中分离出来，对脱粒效果起着决定性的作用。如果设计不合理，脱粒部分的结构可能无法彻底分离籽粒，导致脱粒不尽。此外，如果收割机长期使用或不定期维护保养，可能导致脱粒部分的磨损或故障，进一步影响脱粒效果。
农作物自身的特性也会影响脱粒效果。不同类型的农作物，如小麦、水稻、玉米等，其籽粒形状和结构有所差异，对脱粒部分的要求也不尽相同。如果收割机的脱粒部分没有针对特定农作物进行调整或优化，可能无法满足其脱粒需求，导致脱粒不尽。
此外，收割机操作者的技术水平和操作方法也会对脱粒效果产生重要影响。收割机操作者需要熟悉收割机的使用方法和调整技巧，以便根据实际情况调整脱粒部分的参数，如转速、间隙等，从而达到最佳的脱粒效果。如果操作者缺乏相关知识或技术经验，可能无法正确操作收割机，导致脱粒不尽的问题。