柴油动力在大棚使用的微耕机中非常常见。柴油机的优点是动力强大，扭矩大，适合处理较硬的土壤。而且柴油相对来说更加省油，一次加油可以使用较长时间，对于长时间的连续耕作非常适用。柴油机的维护保养相对简单，使用寿命相对较长。
汽油动力也是一种常见选择。汽油动力的微耕机操作相对简单，启动方便，维护保养也较为容易。汽油机的排放相对较清洁，对环境的污染较小。而且汽油机的噪音相对较低，使用起来比较安静。
电动动力是一种新型的选择。电动微耕机没有废气排放，对环境友好。电动机的噪音也非常低，不会产生过多的噪音干扰。此外，电动机的维护保养成本相对较低，由于没有润滑油的需求，减少了维护工作的复杂性。电动微耕机还可以采用可充电电池，方便农民在没有电源的地方使用。