磨短齿杆会导致收割机的分离效果下降。分离滚筒的齿杆在工作时需要与庄稼的茎和穗接触，通过旋转和摩擦来分离庄稼。但如果齿杆磨短了，它就无法有效地与庄稼接触，分离效果就会减弱。这会导致未完全分离的庄稼残留在秸秆中，给后续作业带来困难。
磨短齿杆还会增加收割机的损耗。齿杆在工作时承受着相当大的力量和负荷，因此必须具有足够的强度和硬度。然而，当齿杆磨短后，其表面积小，接触面积减少，无法承受原本的力量和负荷。这会导致齿杆容易断裂或损坏，从而增加收割机的维修和更换成本。
磨短齿杆还可能引发更严重的故障。齿杆的磨损会导致齿轮和其他配件的磨损加剧，造成更多的故障和问题。例如，磨损的齿杆可能会导致齿轮之间的咬合不良，造成齿轮齿面磨损或齿轮断裂。这些故障将会严重影响收割机的正常工作，需要更长的停机时间和更高的维修成本。