联合收割机在跨区作业时，需要向所在地的农业部门办理跨区操作证件。农业部门是负责监督和管理农业生产的政府机构，他们会对联合收割机的跨区作业进行审核和审批。申请者需要提供必要的材料，如联合收割机的所有权证明、车辆行驶证、驾驶员的身份证明等，以便农业部门核实和记录。
联合收割机在跨区作业时，还需要联系目标地区的农业部门办理相关证件。这是因为不同地区的农业规定可能存在差异，目标地区的农业部门需要确保联合收割机的作业符合当地的规定。申请者需要提供与目标地区相关的材料，如目标地区的农业规定、联合收割机的作业计划等，以便目标地区的农业部门进行审批。
联合收割机在跨区作业时，还需要联系相关交通管理部门办理道路运输证件。道路运输证件是保证联合收割机在公路上合法行驶的必要文件，申请者需要提供联合收割机的技术参数、车辆照片、车辆保险等材料，以便相关交通管理部门核实和审批。