针对拖拉机拉运农作物秸秆超高超宽的问题，应建立相应的监管机制。政府部门应加强对农业运输行业的监管力度，制定明确的法规和标准，对超高超宽的拖拉机进行限制和规范。同时，要加强对农民和运输企业的宣传教育，提高他们对于超高超宽行为的认识，增强道路交通安全意识。
针对拖拉机拉运农作物秸秆超高超宽的违规行为，应进行严厉的处罚。对于超高超宽的拖拉机，可以根据违规的严重程度进行不同的处罚。例如，可以对超高超宽幅度不大的违规行为进行警告、罚款等轻微处罚；而对于超高超宽幅度较大的违规行为，可以采取吊销驾驶证、暂扣车辆等严厉处罚措施。这样的处罚不仅可以惩罚违规行为，也可以起到威慑作用，促使农民和运输企业遵守相关规定。
还应当加强农业运输行业的监督检查。政府部门可以定期对农业运输车辆进行检查，特别是对超高超宽的拖拉机进行重点检查。同时，也可以设置检查站点，加强对农作物秸秆的称重、测量等工作。通过加强监督检查，可以及时发现和处理超高超宽行为，保障道路交通安全和农作物秸秆的运输质量。