大葱锈病用15%粉锈宁可湿性粉剂800～1000倍液、65%代森锰锌可湿性粉剂500倍液，或者用65%代森锰锌1000倍液加15%三唑酮可湿性粉剂2000倍液进行进行防治。一般十天左右喷一次，连续喷两三次。
在大蒜锈病发病初期应及时喷25%菌通散乳油800倍液，或用12.5%禾果利(烯唑醇)可湿性粉剂1500倍液，或50％萎锈灵乳油800～1000倍液，65%代森锰锌可湿性粉剂400～500倍液喷雾，每隔10天喷药1次，连续喷2～3次。
大葱锈病可以用粉锈宁可湿性剂，代森锰锌进行防治。
有25％三唑酮可湿性粉剂2000～3000倍液，50％萎锈灵乳油800～1000倍液，65%代森锰锌可湿性粉剂400～500倍液，喷雾防治。
可以在大葱锈病发病初期，选用10%多抗霉素B可湿性粉剂1000倍液、12.5%烯唑醇可湿性粉剂4000倍液、25%丙环唑乳油2000倍液、30%苯醚甲·丙环乳油3000倍液、45%咪鲜胺微乳剂3000倍液喷洒防治，间隔7-10天喷1次，连续喷洒2-3次。
可以用粉锈宁可湿性粉剂，代森猛锌进行防治。