病菌主要在病种子、病稻草及病稻茬上越冬。新病区的菌源主要来自病区的种子，播种带病种子，可把病菌带人无病稻田。在常发区的菌源，主要来自稻茬和病稻草上越冬的病菌。水稻为连作作物，第1年发病后造成稻荐带菌，下1年仍可继续发病。播种带病种子时，病菌由幼苗的根芽鞘的水孔或伤口侵人，移栽本田后在条件适宜时引起植株发病。病稻草的病菌，随灌溉水流入稻田，从叶片的水孔和伤口侵人引起发病。病斑上产生的菌脓，借风、雨和流水传播，在田间引起反复浸染。
水稻白叶枯病的防治必须因地制宜，综合实行各种有效的防治措施。综合防治策略是：以抗病品种为基础，秧田期预防为重点，在控制菌源前提下，加强农业措施（着重肥水管理），辅以药剂防治。
病原物主要在病稻草、稻桩、再生稻、稻种及一些杂草上越冬，次年主要通过流水、风雨传播，从水稻的气孔或伤口处侵染发病。高温、高湿、多台风、暴雨是病害流行的条件稻田流水串灌、偏施氮«肥、土壤酸性等有利于病害发生。