甘蓝软腐病要做好预防措施，合理轮作，减少土壤的病菌，播种种植前对种植进行药剂拌种，消灭种子携带的病菌。当发生一两株发病，可直接将其拔除带出田间，在对病穴做好消毒工作，如果是局部发病，可用氢氧化铜、代深铵防治，如果是大面积发病则要喷洒水霉素和链霉素防治。
加强栽培管理，避免在菜株上造成伤口；避免连作；实行深沟窄畦栽培，注意排水。早期发现病株，连根拔除，将其深埋，病穴用石灰消毒。及早彻底治虫。发病初期可用以下药剂制止病害蔓延：链霉素200～300万单位；或用抗菌剂“401”0.5千克加水250～300千克喷雾；或敌克松原粉0.5千克浇根。后期药剂可选用72%农用硫酸链霉素可溶性粉4000～5000倍液，或77%可杀得可湿粉2000倍液，或50%福美双可湿粉500倍液加新高脂膜800倍液。发病初期交替喷施药剂3～4次，隔7～10天喷1次。