低温、阴雨、光照不足是诱发立枯病的重要条件，其中以低温影响。在低温条件下幼苗抗病能力降低，有利于病害发生。气温过低，对病原菌发育和侵染影响小，但对幼苗生长不利，根系发育不良，吸收营养能力下降，更有助于病害发展。如天气持续低温或阴雨后暴晴，土壤水分不足，幼苗生理失调，病害发生加重。
水稻立枯病发生适温干旱造成的，应以预防为主。
水稻秧苗素质差、生长弱、抗病抗逆力差，再遇到低温、阴雨、光照不足等因素易发立枯病。
水稻立枯病的发病原因主要有三个，气候条件：低温、阴雨、光照不足是诱发立枯病的重要条件，其中以低温影响最大；侵染循环：水稻立枯病属于土传病害。是由多种病原菌侵染而引起的，主要有半知菌亚门瘤座菌目和鞭毛菌亚门霜霉目等真菌；种苗素质：丝核菌和镰刀菌等水稻立枯病病源菌广泛存在于土壤中，均为弱寄生菌，一般能在水中或土壤内营腐生生活。因此，秧苗素质差、生长弱、抗病抗逆力差是发生立枯病的直接原因。
⑴芽腐出苗前或刚出土时发生，幼苗的幼芽或幼根变褐色，病芽扭曲、腐烂而死。在种子或芽基部生有霉层。⑵针腐多发生于幼苗立针期到2叶期，病苗心叶枯黄，叶片不展开，基部变褐，有时叶鞘上生有褐斑，病根也逐渐变为黄褐色。种子与幼苗基部交界处生有霉层，茎基软弱，易折断，育苗床中幼苗常成簇，成片发生与死亡。⑶黄枯、青枯多发生于幼苗2.5叶期前后，病苗叶尖不吐水，叶色枯黄、萎蔫，成穴状迅速向外扩展，秧苗基部与根部极易拉断，叶片打绺。在天气骤晴时，幼苗迅速表现青枯，心叶及上部叶片“打绺”。幼苗叶色青绿，最后整株萎蔫。在插秧后本田出现成片青绿枯死。
低温、阴雨、光照不足是诱发立枯病的重要条件，其中以低温影响最大。在低温条件下幼苗抗病能力降低，有利于病害发生。气温过低，对病原菌发育和侵染影响小，但对幼苗生长不利，根系发育不良，吸收营养能力下降，更有助于病害发展。
水稻立枯病主要是土壤水份问题，旱育秧发生多，水育秧很少发生。