①适期播种，适当晚播，不要过早，可减轻秋苗期条锈病发生。②清除自生麦。③提倡施用酵素菌沤制的堆肥或腐熟有机肥，增施磷钾肥，搞好氮磷钾合理搭配，增强小麦抗病力。速效氮不宜过多、过迟，防止小麦贪青晚熟，加重受害。④合理灌溉，土壤湿度大或雨后注意开沟排水，后期发病重的需适当灌水，减少产量损失。
在小麦苗期，每亩用1000亿芽孢/克枯草芽孢杆菌可湿性粉剂15-20克，对水后均匀喷雾，兼防赤霉病、白粉病；在小麦返青拔节期或条锈病发生初期，每亩可用2%嘧啶核苷类素（农抗120）水剂333-500克，对水均匀喷施，隔7-10天喷1次，视病情喷施2-3次；在发病前的拔节期至抽穗期或条锈病发病初期，每亩可用短小芽孢杆菌QST2808菌株可湿性粉剂333-533克，对水均匀喷施叶面。
发病期喷敌锈钠400倍液或0.2～0.3波美度石硫合剂或50%二硝散200倍液或25%粉锈宁700倍液，每隔7～10天喷一次，连续喷2～3次。