密度过大，氮肥使用过多，稻飞虱严重均会诱发纹枯病。
该病是由真菌引起的,病原菌为担子菌亚门真菌瓜亡革菌，病原菌在稻田中越冬,为初侵染源。春耕灌水时,越冬菌核与浮屑、浪渣混杂漂浮在水面上,黏附在稻株上进行侵染,形成病斑。病斑上的病菌通过接触侵染邻近稻株而在稻丛间蔓延。病部形成的菌核落入田中随水漂浮,进行再侵染。抽穗前病部新生菌丝以横向蔓延为住,抽穗后主要沿稻秆表面向上部叶鞘、叶片蔓延侵染,孕穗至抽穗期侵染最快,抽穗至乳熟期单株病害向上蔓延最快。早稻菌核成为晚稻主要病源。
水稻纹枯病的发病条件有：长期深灌、生长前期偏施氮肥、过度密植、温度适宜湿度过高、种植抗病性不强的品种等。病原菌主要是半知菌及担子担孢子菌。
水稻纹枯病是由立枯丝菌核引起的，属半知菌亚门真菌。