芹菜灰霉病的病原主要以菌核在土壤中或在病残体上越冬或越夏。条件适宜时病原借气流、雨水、露珠及农事操作传播，从植株伤口或衰老的器官及枯死的组织上侵入。
病菌以菌核或分生孢子随病株残余组织遗留在田间越冬，菌核萌发出菌丝体并产生分生孢子梗及分生孢子，借气流传播至寄主作物上，从寄主伤口、衰弱及坏死组织部位侵入，引起初次侵染。
主要以菌核在土壤中或以菌丝及分生孢子在病残体上越冬或越夏。翌春条件适宜，菌核萌发，产生菌丝体和分生孢子梗及分生孢子。分生孢子成熟后脱落，借气流、雨水或露珠及农事操作进行传播，萌发时产出芽管，从寄主伤口或衰老的器官及枯死的组织上侵入，发病后在病部又产生分生孢子，借气流传播进行再侵染。