在黄瓜苗期到结果期都有机率患上枯萎病，从而导致整株枯死。因此在种植黄瓜时，应选用抗病品种，实施合理轮作，并加强栽培管理。在发病初期，使用液瑞锌合剂或多菌灵粉剂进行喷雾或灌根防治。
防治要以预防为主，结合使用抗病品种，采取轮作倒茬或嫁接等栽培管理措施。
黄瓜枯萎病的防治：选用抗病品种、合理轮作、加强肥水管理、发病初期及时用药防治以及清洁田园等。
可以及时选用药剂，防治黄瓜枯萎病开始喷洒青枯立克500倍液进行灌根，7天左右用药1次，每个时期连用2-3次；同时在黄瓜枯萎病发病初期，选用药剂可用50%多菌灵500倍液、50%苯菌特1500倍液、60%琥乙磷铝350倍液、50%的甲基托布津1000倍液、40%的双效灵800倍液、70%的敌克松1000-1500倍液等农药灌根预防和，高科30%甲霜恶霉灵、38%恶霜嘧铜菌酯600-800倍液效果显著。以早预防和早治效果较好，可7-10天灌1次，连灌3次，药剂进行交替使用，可以控制黄瓜枯萎病，效果显著。
黄瓜枯萎病防治重在预防，结合生态调控、生物防治等措施，达到防治指标时，科学施用高效低毒低风险农药控制。