小麦赤霉病是气候性病害，要在齐穗前化学药剂预防。
预防为主，综合防治，农业防治为主，化学防治为辅。
在小麦齐穗期喷施多菌灵或甲基托布津防治效果较好。
小麦赤霉病是一种气候型病害，病原菌孢子在田间大量存在，小麦抽穗扬花期，如遇高温高湿天气，则大发生，该病害防治以预防为主，在小麦抽穗扬花期结合小麦一喷三防用药（杀虫剂杀菌剂叶面肥）进行防治。麦田一旦发病后很难防治。
小麦赤霉病防治，选用抗病品种，增施优质土杂肥和磷钾肥，清除病残体，适期播种，合理密植，特别是小麦齐穗至初花期用戊唑咪鲜胺等农药喷施防治等。
若在穗遇连阴雨应在扬花初期喷氰烯菌酯，连喷2次。