小麦条锈病的症状特点有以下几点：成株叶片初发病时夏孢子堆为小长条状，后期表皮破裂，出现锈褐色粉状物。小麦快成熟的时候叶鞘上会出现圆形或者卵圆形的黑褐色夏孢子堆，后期病部产生黑色冬孢子堆，且呈扁平堆短线状。还有叶鞘和茎秆，穗部、颖壳及芒上也会有条锈病的发生。
小麦发生条锈病后茎秆、麦穗、叶片等都会发病，其叶片褪绿，有成行排列的鲜黄色疱斑，或者是黑色疱斑。
小麦锈病的主要症状是“条锈成行叶锈乱”。具体区分为：小麦叶锈病，夏孢子堆发生在叶片上，夏孢子堆小，橙黄色，圆形至长椭圆形，不规则排列；冬孢子堆主要在叶背面和叶鞘，黑色，阔椭圆形至长椭圆形，散生，埋于表皮下，有依麦秆纵向排列成行的趋向。小麦条锈病，以为害叶片为主，也可侵染叶鞘、茎秆和穗部；叶片上夏孢子堆较小，鲜黄色，狭长型至椭圆形，排列成条状并与叶面平行；冬孢子堆黑色，狭长形，埋于表皮下，排列成条状。
小麦锈病主要发生在叶片上，苗期到成株期均可发病，叶片受害产生大量，黄色粉包尾叶脉平行排列成条状，像缝纫机扎过的针脚一样，后期表皮破裂出现秀色粉状物，造成叶片早衰产量下降。