辣椒缺镁时叶片的脉间叶肉会黄化，病症往往从植株下部叶片开始，随着时间的推移，缺绿黄化症状会逐渐向幼叶发展，最终缺镁植株全部叶片显症。
缺镁时，辣椒叶片为灰绿色，叶脉间黄化，基部叶片脱离，植株矮小，坐果少。缺镁症状出现在靠近果实的叶片上时，生长的初期不发生，果实开始膨大时症状开始出现。果实膨大时，靠近果实的叶片的叶脉间开始发黄。在生长的后期，除叶脉残留绿色外，叶脉间均变黄，严重时，黄化部分变褐，落叶（低地温引起根吸收不良，特别是磷和镁的吸收都不良时，或大量施用含钾多的有机肥时易发生此症）。缺镁与缺锌的症状区别是：缺镁症状不在新叶上发生；缺镁症多在土壤比较酸的情况下发生。缺镁时在顶端新叶上表现的症状为幼叶和新叶呈黄白色，叶脉残留绿色（土壤酸性，多肥、多湿的条件下，容易出现此症）。