菠菜枯萎病要及时用百菌清喷雾预防，并加强田间水肥管理即可。
选用抗病品种，抓好肥水管理，当增施磷钾肥，避免偏施过施氮肥，发现病株及时拔除，同时喷施多菌灵。
菠菜枯萎病会使植株明显矮化、死亡，因此要注意防治。在种植中，避免连作，并施足有机肥，雨后及时排水除湿。如果发病，将病株拔除，并喷施多菌灵可湿性粉剂或治萎灵水剂等农药。
抓好肥水管理，当增施磷钾肥，避免偏施过施氮肥，适时喷施叶面肥加新高脂膜使植株早生快发；适当浇水，勿使田土过干或过湿，雨后注意清沟排渍降湿；在菠菜生长阶段适时喷施壮茎灵，使植物杆茎粗壮、叶片肥大，提高菠菜抗病力，减少农药化肥用量，降低残毒，提高菠菜天然品味。
防治措施：①与葱蒜类、禾本科作物3～4年轮作，避免连作；施用充分腐熟的有机肥，并采用配方施肥技术，提高抗病力；采用高畦或起垄栽培，雨后及时排水，严禁大水漫灌。②药剂防治。发现病株及时拔除，病穴及四周浇、喷50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、40%多硫悬浮剂500倍液、10%治萎灵水剂300～400倍液，隔15天喷一次，连喷2～3次。