药剂防治发病初期喷洒75%百菌清可湿性粉剂800倍液或70%甲基硫菌灵可湿性粉剂600倍液、25%苯菌灵乳油800倍液、50%多菌灵可湿性粉剂600倍液，间隔7—10天一次，连防2—3次。
玉米小斑病防治，选用抗病品种，增施有机肥和磷钾肥，清除病残体，适期播种，合理密植，加强肥水管理，使用包衣种子，发病初期用百菌清等农药喷施防治等。
广谱性杀菌剂防治玉米小斑病都有效，如信生、噻呋酰胺、阿砣等。
1)因地制宜选种抗病杂交种或品种，2)加强农业防治清洁田园，深翻土地，控制菌源；摘除下部老叶、病叶，减少再侵染菌源；降低田间湿度；增施磷、钾肥，加强田间管理，增强植株抗病力。(3)药剂防治发病初期喷洒75%百菌清可湿性粉剂800倍液或70%甲基硫菌灵可湿性粉剂600倍液、25%苯菌灵乳油800倍液、50%多菌灵可湿性粉剂600倍液，间隔7—10天一次，连防2—3次。