一、合理控制棚内温度：尤其是夏季注意控制棚内温度不要太高，不能长时间连续高于35℃，可以通过大水漫灌、拉遮阳网、喷降温剂等措施进行降温。二、合理使用蘸花药：注意蘸花浓度，随温度升高而相应降低浓度，点花浓度过高还会“烧花”。一般来说，点花药2,4-D的使用浓度为10~20ppm，并且越往上的几穗花蘸花药浓度越低。三、及时疏果：一旦发现畸形果要及时疏掉，尤其是秋延迟的第一穗果，由于前期高温很容易形成畸形果，早疏掉防止养分浪费。而且第一穗果不易留果过多，一般2-3个正常果即可。
若畸形果多、坐果难等问题，单纯靠增加激素浓度副作用很大，效果却不一定好。建议菜农采取摘心换头的方法，在西红柿坐果2-3穗后，摘除植株生长点，保留一个长势较旺的侧枝。侧枝的生长发育较晚，若前期花芽分化受到影响，摘心换头是一个较好的解决办法。