该菌在桧柏上越冬,翌年3―4月产生米粒大小红褐色冬孢子堆,遇雨后膨胀而形成一团褐色胶状物体,上面的冬孢子萌发产生担孢子,担孢子借风进行传播,对宣木瓜产生侵染。宣木瓜病斑上产生的锈孢子器,其锈孢子随风重新飘落到桧柏上,侵入后在桧柏上越冬。
木瓜锈病病菌一般在受害果树或果园周边植物上越冬、越夏,在气温达到17—20℃时借风飞至木瓜叶或幼果上入侵,病菌可以借水从表皮直接侵入发病。
木瓜锈病发生的轻重与转主寄主、气候条件、品种抗性等密切相关。一般患病圆柏越多,木瓜锈病发生越重;病原菌只侵染幼嫩组织,当木瓜幼叶初展时,如遇天气多雨,温度又适合冬孢子萌发,风向和风力均有利于担孢子的传播,则发病重,反之则发病轻微。