木瓜锈病发生的轻重与转主寄主、气候条件、品种抗性等密切相关。一般患病圆柏越多,木瓜锈病发生越重;病原菌只侵染幼嫩组织,当木瓜幼叶初展时,如遇天气多雨,温度又适合冬孢子萌发,风向和风力均有利于担孢子的传播,则发病重,反之则发病轻微。