苹果锈病幼果受害，初期症状与受害叶片症状相似，在果面产生橙黄色病斑，以后病斑凹陷，形成黑色木栓化硬疤，其上生有小黑点和毛状物。病部生长停滞，而形成畸形果，容易早落。
苹果锈果病又称花脸病、裂果病，是由苹果锈果类病毒侵染所引起的、发生在苹果上的一种病毒性病害。主要为害果实，也为害叶片和茎干。发病后虽有产量，但产量降低，品质变劣，果实不堪食用。
幼果染病后，靠近萼洼附近的果面上出现近圆形病斑，初为橙黄色，后变黄褐色，直径约10-20毫米。病斑表面也产生初为黄色、后变为黑色的小点粒，其后在病斑四周产生细管状的锈孢子器，病果生长停滞，病部坚硬，多呈畸形。嫩枝发病，病斑为橙黄色，梭形，局部隆起，后期病部龟裂。
这样患了锈病的苹果危害不算很大，只是卖相不好。
苹果果锈病是一种生理病害，其症状是在苹果果实表面产生类似金属锈状的木栓层，严重影响外观品质和商品价值。