小麦赤霉病最容易在抽穗扬花期发生，即4月中旬到5月中旬之间，因此防治一般在这个阶段进行效果较好。以结果为导向，持续跟进落实，对工作懈怠、措施不力、贻误农时的，对有关单位和责任人进行追责问责。小麦赤霉病在抽穗、扬花期防治，到成熟就没有残留药毒。
小麦赤霉病绿色防控技术包括：1. 杀菌剂拌种；2. 苗期、拔节期、孕穗期喷几遍杀菌剂可防控赤霉病。小麦赤霉病对小麦产量的影响较大，需及时防治，包括及时检测发现、采取绿色农药进行防治、选择抗病虫品种。
小麦赤霉病可导致小麦发生穗腐，即造成小麦部分或全部腐烂，表现症状为侵染初期在颖壳上呈现边缘不清的水渍状褐色斑，渐蔓延至整个小穗，病部褐色或枯黄，潮湿时可产生粉红色霉层（分生孢子），空气干燥时病部和病部以上枯死，形成白穗，不产生霉层，后期病部可产生黑色颗粒（即子囊壳），严重减低小麦的产量以及小麦的品质。