大葱紫斑病的传播途径是风雨昆虫及农事操作。
分生孢子通过气流传播，从伤口、气孔或表皮直接侵入致病。病菌孢子形成、萌发和侵入均需有水滴存在，故温暖多湿的天气和植地环境有利于发病。
病菌以菌丝体在寄主体内、种苗上或随病残体在土中越冬，也可以继续为害贮存的葱。在条件适宜时产生分生孢子，借气流、雨水传播。
冬季温暖地区病菌在葱蒜作物上辗转传播危害。寒冷地区则以菌丝体附着寄主或病残体上越冬。翌年产生分生孢子，借气流或雨水传播。病菌从气孔和伤口，或直接穿透表皮侵入，潜育期1～4天。分生孢子在高湿条件下形成。