该病主要危害马铃薯块茎，最初在块茎表面产生浅褐色小点，逐渐扩大成褐色近圆形至不定形大斑，以后病部细胞组织木栓化，使病部表皮粗糙，开裂后病斑边缘隆起，中央凹陷，呈疮痂状，病斑仅限于皮部，不深入薯内；匍匐茎也可受害，多呈近圆形或圆形的病斑。
马铃薯疮痂病主要危害块茎。块茎染病，表面初生褐色小斑点，扩大后形成圆形或不规则形、中央凹陷、边缘凸起、表面粗糙的褐色病斑；因产生大量木栓化细胞，导致表面粗糙而呈疮痂状，一个薯块上病斑少者数个，多者数十个，并由数个病斑合并成大斑块，可布满整个薯块表面。病斑仅限于皮部，不深入薯内。