加强田间调查监测，在发病初期噴施对应杀菌剂预防。
（1）选用抗病品种为最基本的防治措施。（2）合理轮作（3）清除田间残枝病叶。（4）利用杀真菌药剂处理种子处理，例如用拌种双、多菌灵或福美双的种衣剂拌种。（5）在开花结荚初期可喷洒多菌灵、甲基托布津等杀菌剂。
开花始期、蕾期、结荚期、嫩荚期各喷1次30%碱式硫酸铜悬浮剂400倍液，或50%多·霉威可湿性粉剂1000倍液，或80%乙蒜素乳油1000~1500倍液，或50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液，或36%甲基硫菌灵悬浮剂500倍液。
当大豆种植过程中，田间已发生了紫斑病，要及时打药进行防治，越早越好，也可提前打药预防，可选择药剂有：苯醚甲环唑、甲基硫菌灵、多菌灵等，可选择的杀菌剂有很多，根据当地具体情况具体选择，一次不行，可多次喷施。
大豆幼苗受害症状：大豆苗期染病，子叶上产生不规则褐色斑点，云纹状。幼茎变细，幼株提前死亡。