杂交水稻秧苗白化的原因很复杂，有人认为与缺锌有关。由于发生率很低，可以忽略。
缺锌元素，或莠去津等除草剂药害，也有可能是基因变化。
水稻秧苗白化一是生理性。二是低温寡照。三是缺锌。由于发生较少，一般忽略。
