在发病初期喷20%甲基立枯磷乳油1200倍液，或50%退菌特可湿性粉剂500～800倍液，或75%百菌清可湿性粉剂600～700倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂800～1000倍液。隔7～10天喷1次，连续1～2次。
必要时喷洒20%甲基立枯磷乳油1200倍液。
发病初期在茎基部浇施或喷40％五氯硝基苯的1000倍液效果很好。中国江苏防治大豆纹枯病的经验是在发病初期用10%甲基砷酸钙（稻宁）1000倍液喷雾，亩用稀释药液100千克，或用10%甲基砷酸钙0.5千克加细土50千克配成毒土，每亩撒施毒土25千克，用20％稻脚青1000倍液防治大豆纹枯病的效果亦很好。