绿色植物在一段时间内水分丰富，壤水分突然变化，水少的情况下，青果的肚脐缺水多，机构萎缩。缺钙，导致脐细胞生理混乱。
1.土壤干旱缺水、空气湿度低：当番茄缺水时，叶片蒸腾消耗所需的大量水分与果实进行争夺，叶片夺走输送到幼果中的水分，甚至还将幼果内的水分吸出。由于果实突然大量失水，导致生长发育受阻，形成脐腐。2.施肥欠妥，用肥不当：使用未经腐熟的生粪、肥料使用过多、距根系太近，引起烧根，使根系吸水受抑制，造成生理缺水，这也是发生脐腐病的重要因素。另外，单施氮肥、氮肥过量或磷钾肥不足，容易引起局部缺钙，导致脐腐病的发生。施用未经腐熟的有机肥、肥料使用过多、距根系太近，引起烧根，使根系吸水受抑制，造成生理缺水，这也是发生脐腐病的重要因素。
西红柿脐腐病是生理性病害，需要喷施含钙的叶面肥，注意氮磷钾肥料均衡使用。