菠菜心腐病主要危害菠菜的茎基部、叶、茎和根。种子带菌的菠菜发芽后染病，出土后幼苗茎基变褐、缢缩，引致猝倒或腐烂，造成缺苗。大苗发病时，根茎处变褐、缢缩，植株外叶黄化，心叶坏死，或半边黄化半边坏死，最后腐烂。发病后病茎基部产生不明显的小黑点。
