用50%异菌脲可湿性粉剂、50%腐霉利可湿性粉剂或2.5%咯菌腈悬浮种衣剂按种子重量的0.2%-0.3%拌种，提高萝卜抗病性；在萝卜生长过程中，施用充分腐熟的优质有机肥，并增施磷、钾肥，适时适量浇水；收获后及时清理田间病残体并带出田外深埋或烧毁。
萝卜黑斑病发病前至发病初期，可采用下列杀菌剂进行防治：50%甲·米·多可湿性粉剂1500-2000倍液＋70%代森联干悬浮剂800倍液；60%琥铜·锌·乙铝可湿性粉剂600-800倍液＋75%百菌清可湿性粉剂600-800倍液；64%氢铜·福美锌可湿性粉剂1000倍液；50%甲基·硫磺悬浮剂800-1000倍液＋70%代森锰锌可湿性粉剂700倍液；对水喷雾，视病情间隔7-10天喷1次。
发病普遍时，可采用下列杀菌剂或配方进行防治：20%唑菌胺酯水分散粒剂1000-1500倍液；10%苯醚甲环唑水分散粒剂1000-1500倍液＋75%百菌清可湿性粉剂600-800倍液；50%异菌脲可湿性粉剂1000-1500倍液；50%福美双·异菌脲可湿性粉剂800-1000倍液；对水喷雾，视病情间隔5-7天喷1次。
喷施20%噻菌酮500倍液，75%百菌清可湿性粉剂500～600倍液，50%灭菌脲可湿性粉剂1000倍液，58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液，50%腐霉利可湿性粉剂1500倍液，40%灭菌丹可湿性粉剂600倍液，80%喷克可湿性粉剂600倍液，每隔7～10天防治1次，连续喷施3～4次。
