疫苗的合理使用是关系到免疫成败的关键。疫苗接种前，不得任意变更；养猪户应按照以下方法合理使用疫苗。注射病毒性活疫苗的前后各4天内不准使用抗病毒药物和干扰素等，两种病毒性活疫苗一般不要同时接种，应间隔7～10天，以免产生相互干扰。
种公猪一年两次集中免疫，每次接种4-6头份；种母猪断奶后与其仔猪同时免疫，母猪接种4-6头份，仔猪接种2-3头份，仔猪50-60日龄左右加强免疫，每头猪接种3-4头份的免疫接种程序。此种免疫程序在免疫前最好还是先测定仔猪的断奶时的母源抗体效价，再确定免疫的时间和剂量。这一剂量有两方面的含义，一是指母猪的接种剂量，另一是指仔猪的接种剂量。一般情况而言，血液中母源抗体的中和效价：仔猪3～15日龄时抗体滴度为1:65以上，保护率为100%；20日龄时抗体滴度降至1:32，保护率为75%，为临界线；30日龄时抗体滴度为1:16以下，无保护力。疫苗免疫一定要避免母源抗体的干扰，以25日龄和65日龄2次免疫为好。多数学者认为适当提高免疫剂量有利于提高抗体水平，但加大剂量亦可中和一定的母源抗体。可供参考的免疫剂量为种猪4～5头份；仔猪2～3头份；仔猪母源抗体在1:32以上时，以4头份疫苗剂量的免疫效果最佳。
猪瘟苗均是活疫苗，大剂量注射疫苗，无形中就给机体内注入了大量癿病毒，就会给健康猪埋下潜伏癿病原或加重病猪癿疫情。其次，大剂量使用猪瘟苗，丌仅造成了疫苗癿浪费，增加了成本，而且从长进来看，会影响猪瘟病毒癿生态变化以及机体正常免疫能力癿产生，甚至产生免疫耐受现象。再其次，猪瘟活疫苗癿生产过程，有时会収生被牛病毒性腹泻病毒(BVDV)污染癿情况，这会使疫苗癿免疫效能下降，甚至免疫失败(这是猪细胞苗存在癿问题)。在这种情况下大剂量使用猪瘟疫苗，必然会增加疫苗对猪体癿副作用。大剂量注射猪瘟疫苗，会造成猪体长时间带毒、排毒，猪场很难净化猪瘟，甚至猪场一旦収病，猪瘟都会起到主要作用。所以，对于猪瘟苗癿使用，应当科学合理，按照实际情况定量免疫猪瘟疫苗。
使用猪瘟苗要用专用的冷链箱携带，器械严格消毒，用专用稀释液稀释疫苗，在耳根后部位消毒后颈部肌肉注射一毫升，稀释疫苗在三小时内用完。
肌肉或皮下注射。使用时按瓶签注明头份用无菌生理盐水按每头份1毫升稀释，大小猪均为1毫升。该疫苗禁止与菌苗同时注射。注射本苗后可能有少数猪在1天-2天内发生反应，但3日后即可恢复正常。注苗后如出现过敏反应，应及时注射抗过敏药物，如肾上腺素等。
应该仔细检查疫苗外观质量，看看疫苗瓶是否破损，瓶盖或瓶塞是否松动，标签是否完整。疫苗生产日期，有效期，生产厂家。并且按照疫苗说明注射计量注射猪瘟疫。
在有疫情威胁时，仔猪可在21-30日龄和65日龄左右时各注射1次。被注射猪必须健康，如体质瘦弱、有病，体温升高或食欲不振等均不应注射。免疫使用各种工具，须用前消毒，每注射1头猪必须更换一次煮沸消毒过的针头，严禁打飞针。注射部位应先剪毛，然后用碘酒消毒，再进行注射。如在有猪瘟发生的地区使用，必须由兽医严格指导，防疫人员应在一周内逐日观察。
猪瘟疫苗，保存在零下15度左右，耳后颈部肌肉或皮下注射，均注射1ml。免疫期18个月。用专用稀释液，疫苗稀释后，气温15度以下6小时内用完。15一27度3小时内用完。
猪瘟疫苗目前主要有四种：脾淋苗、乳兔苗、细胞苗和联苗。这四种疫苗的猪瘟毒株虽然均是中国系猪瘟兔化弱毒株（简称c株），但彼此间还是有一定的区别。
被注射猪必须健康，如体质瘦弱、有病，体温升高或食欲不振等均不应注射。免疫使用各种工具，须用前消毒，严禁打飞针。