造成腹泻的原因也就更多了。比如：因为消化原因导致的营养性腹泻，因为细菌感染导致的细菌性腹泻，还有可能是病毒导致的腹泻。
仔猪断奶后过度限饲或者饲喂，容易引发仔猪饥饿性和过食性腹泻。另外饲料中油脂含量过高，会导致仔猪食用后不能消化而腹泻。霉变的饲料中含有大量的毒素，也会引起仔猪消化机能紊乱从而导致腹泻。
病原微生物的感染是造成断奶仔猪腹泻的主要原因之一，由细菌感染引起的腹泻常见有致病性大肠杆菌及沙门氏菌感染引起的腹泻；由病毒感染引起的腹泻主要有轮状病毒感染、冠状病毒感染引起的猪传染性胃肠炎和猪流行性腹泻。