生物致病因素主要有病毒、细菌、支原体等。
病毒性因素：能引起猪免疫抑制的病毒性因素很多，如蓝耳病毒、猪瘟病毒、猪圆环病毒Ⅱ型、猪流感病毒、伪狂犬病毒、猪细小病毒等。
细菌性因素：有肺炎支原体、胸膜肺炎放线杆菌等。
寄生虫因素：主要有弓形体和猪附红细胞体。
毒素中毒因素真菌产生的各种毒素不仅能引起肝细胞变性坏死，而且可溶解淋巴细胞，使体液免疫和细胞免疫调节机能受到抑制，还能抑制细胞的分裂和蛋白质的合成，影响核酸的复制，降低免疫应答等，使猪的抗病力低下，造成母猪不孕、种公猪配种能力低下，消化机能紊乱，仔猪生长缓慢，诱发多种疾病。
应激因素在过热、过冷、拥挤、断奶、混群、运输等应激状态下，猪体内会产生异常代谢产物，同时某些激素(类固醇)水平也会大幅提高，它们会影响淋巴细胞活性，引起明显的免疫抑制。
营养性因素某些维生素(维生素B、维生素C等)和微量元素(铜、铁、锌、硒等)是免疫器官发育，淋巴细胞分化、增殖，受体表达、活化及合成抗体和补体的必需物质，若缺乏或过多或各成分间搭配不当，必然诱导肌体继发性免疫缺陷。
药理性因素研究证明，链霉素、新霉素、卡那霉素、四环素、糖皮质激素等药物或对动物体内抗体的形成有抑制作用，或对T、B淋巴细胞的转化有明显抑制作用，从而影响免疫效果。磺胺类与副肾皮质激素类药物也可引起短时的免疫抑制，少量使用时停药后可恢复，若长期应用会造成严重后果。
疫苗因素不按科学的免疫程序使用疫苗，疫苗免疫剂量不够或超量，或疫苗免疫次数过多等，都会造成猪体免疫麻痹，导致免疫抑制。而且，有些疫苗佐剂也可引发免疫抑制。经试验，在圆环病毒Ⅱ型感染的早期，所有疫苗佐剂都会加重此病毒感染引起淋巴组织缺损的严重程度；而在感染后35天，油包水佐剂仍可加得病损的程度。