危害平菇的害虫主要有跳虫、菇蚊、线虫等。可采用灯光诱杀，利用菇蚊、跳虫成虫趋光性进行黑光灯诱杀。利用防空洞作菇房的，进出口须留几十米的黑暗通道，阻止成虫趋光而入，进出要随手关灯。药剂防治应在菇采摘后进行，可喷1000倍的敌敌畏或敌百虫。线虫严重的地方，可用10%的光线灵颗粒剂拌料，每2-2.4吨培养料用10%的颗粒剂60克。也可在种菇前，菇房地面、菇床、四壁喷洒800倍的敌敌畏或敌百虫。每立方米空间用10毫升甲醛与敌敌畏（1:1）熏蒸24小时。平菇发生病害时可喷施50%1:500倍多菌灵，或65%代森锌，或喷洒每毫升含100-200单位的链霉素。
