猕猴桃吸收养分主要靠根系，根系的生长与枝、叶、果的生长关系密切，是科学施肥的重要依据之一。一般春季地温开始回升时，猕猴桃根系随之开始生长，在6月份新梢生长减缓时，根的生长却是达到高峰，在9~10月秋梢停止生长，果实均已成熟，此时叶片制造的大量养分会输向根系，从而促使根系快速生长，这时最适宜施用基肥，以利于植株恢复树势和促进花芽分化。
基肥应在秋季果实采收后（11月中旬以前）施入，越早越好。实践证明，基肥秋施比春施好，早秋施用比晚秋或者初冬施用好。
猕猴桃施用基肥，有机肥可用家畜粪便或饼肥，家畜粪便需要充分腐熟才能施用。将有机肥、无机肥（氮、磷、钾）和中微量元素配合施用，施用以有机肥为主。全部有机肥及化肥中，有机肥占70%~80%，氮、磷、钾肥料则占20%~30%，中微量元素与有机肥混合施入。一般每亩产果2500公斤，施入基肥应在2500公斤。
基肥施放位置一般在株间或树冠的滴水线处，采用沟施或穴施效果最好，沟或穴的深度一般在40~50厘米，操作时尽量避免对猕猴桃根系的伤害。基肥施入后应覆土。
