【症状】冬瓜定植后始见发病，发病初期晴天中午出现暂时性萎蔫，初期还能恢复;后终因不能恢复而枯死，拨出根茎部可见水浸状褐色病变，剖开病根腔腐烂部已变色，严重的仅留下丝状输导组织，茎蔓内椎管束一般不变褐，别于枯萎病。近年根腐病呈上升态势。
【病原】称瓜类腐皮镰孢菌，属半知菌类真菌。大型分生孢子梭形或肾形，无色，透明，两端较钝，具隔膜2~4个，以3隔居多，大小14-16*2·5~3·0微米。小型分生孢子椭圆至卵形，具隔0~1个，大小6一11*2·5一3微米。在PDA培养基上菌丝呈绒毛状，银白色，基物表面为猪肝紫色，培养基不变色;在米饭培养基上呈银白至米色;在马铃薯块和绿豆培养基上均为银白色至浅褐色。
【病因】以菌丝体、厚垣孢子或菌核在土壤中及病残体上越冬。尤其厚垣饱子可在土中存活5~6年或长达10年，成为主要侵染源，病菌从根部伤口侵入，后在病部产生分生饱子，借雨水或灌溉水传播蔓延，进行再侵染。高温、高湿利其发病，连作地、低洼地、粘土地或下水头发病重。
【防治方法】
(1)选用菠萝种、冠星2号耐寒和耐雨水的节瓜品种。有条件的与十字花科、百合科作物实行3年以上轮作。
(2)采用高畦栽培，认真平整土地，防止大水漫灌及雨后田间积水，苗期发病要及时松土，增强土壤透气性。
(3)施用酵素菌沤制的堆肥或充分腐熟的有机肥。使土壤有机质含量高于2%，适量施用化肥，防止土壤酸化，施用SH土壤添加物，如动物粪便、糠敖、锯末、骨粉、饼肥、蔗渣、菇类堆肥、泥炭等可防止根腐病的发生。
(4)科学管理水分，防止水分过多，过量，避免高湿条件出现，可减少发病。
(5)用40可拌种双粉剂每平方米8克处理土壤。
(6)发病初期喷洒或浇灌50%根腐灵可湿性粉剂800倍液或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、60％防霉宝超微可湿性粉剂800倍液、50可杀菌王水溶性粉剂1000倍液，采果前3天停止用药。
(7)必要时喷洒植物动力2003对根腐病有兼治作用。