棉花是一种补偿能力较强的作物，一般受淹时间在72小时、没顶时间在36小时以内，只要补救方法得当，可以使棉花恢复生机。主要措施为：
抢排积水深挖清理内外“三沟”，力争排除地表水，降低地下水。
扶正棉株和中耕培土对受淹后的棉株要及时清洗枝叶上的泥浆污物，结合中耕培土，扶正倒伏或倾斜的棉株，促进通气扎根，提高光合效率。
适时追肥棉花受淹后根部吸收能力下降，因此，对棉株要采用叶面喷肥与根部施肥相结合的方法适时追肥。叶面喷肥，每亩可用0．3％的磷酸二氢钾和2％的尿素溶液，一次喷施60公斤，连喷2次—3次;根部施肥，每亩可施尿素5公斤—7．5公斤，饼肥40公斤。
此外，要适时防治棉铃虫、棉蚜虫和其它突发性害虫。