水稻收割机结构复杂，一次性投资较大，而使用时间短，闲置存放时间长。因此，在秋收作业结束后，要及时科学做好水稻收割机的维护保养和封存工作。
一、清洗。秋收结束后，要及时将收割机内外的泥土、碎稻草、谷粒等杂物清理干净，并用水冲洗1—2遍，在院坝晾干后再开进机库内存放好。同时，对机身需用厚实的薄膜覆盖，以防止灰尘进入。
二、分拆。卸下全部的三角传动带，擦干净后，涂上滑石粉，用塑料袋装好，挂在库内的墙壁上；卸下传动链条放入柴油中清洗干净，涂上机油，用塑料纸包好。
三、检查。要全面检查收割机上的易磨损件，如割台上的动刀片与定刀片，搅龙伸缩杆套，滚筒钉齿等。
四、除锈。向各部件上的转动轴承加注润滑脂，对摩擦部位，如切割器，离合器爪，搅龙伸缩杆，调整螺栓等，要涂上机油或黄油，防止锈蚀。
五、垫放。用方木头将收割机垫离地面，把割台、拨禾轮降到最低位，平稳地放在垫木上，使液压升降系统的升降手柄，放在下降的位置上。
六、蓄电池存放。卸下蓄电池，要单独进行存放。将蓄电池充足电后倒出电解液，换入蒸馏水，停放6小时，再充电4小时，更换蒸馏水后再充电2小时，然后倒出蒸馏水，再装满新蒸馏水，即可长期存放，在冬季要注意保温防冻；也可将蓄电池完全放电，倒出电解液后用蒸馏水多次冲洗，直到水无酸性为止，倒净蒸馏水，晾干后，拧紧孔盖，密封通气孔，即可长期存放。
七、大灯和油箱保护。要把发电机，照明大灯等主要电器件，卸下后擦干净，单独妥善保存，以防碰坏。将发动机水箱，机体，等放水开关打开，放净水；放出油箱中的燃油；用塑料布将空气滤清器，排气管口，燃油箱加油口等部位包好；向气缸内注入适量的清洁机油，并转动曲轴数圈。
八、发动机例检。封存后，每个月用手摇把摇转发动机曲轴转动2次以上，并向气缸内注入少量清洁机油，将液压升降手柄前后拨动10—20次，以保持灵活性。