电动喷雾器配备不同的水泵就有不同的使用方法，只有根据水泵类型进行正确使用，才能使水泵的寿命最多大化。
电动喷雾器的水泵一般都是配备隔膜泵，隔膜泵又分为智能隔膜泵和回流隔膜泵。因为两者的工作结构不同，所以在使用方法上也不同。智能水泵与回流水泵的主要区别是在其对工作压力的控制方法上。
智能泵是在泵头里添加了一个电子压力开关，当水泵的出水腔压力达到预设的值时，就会触动电子压力开关关闭电机的工作电流，达到保护、省电的目的。所以配备智能水泵的电动喷雾器一定要安装电子调速开关和带开关功能的手柄。安装电子调速开关可以解决电机转速的问题，在使用细眼小喷头时可调节出适度的出水流量，达到最优化的配置；使用带开关功能的手柄可以实现一些特殊的功能，可以实现点打。所以在使用配备智能水泵的电动喷雾器，最关键的一点就是在使用过程中一定要根据喷头流量的大小用电子调速开关进行调节，调节出最匹配的流量，不然会出现哒哒的异响，也就是电机的频繁开关造成的响声，这样对水泵的使用寿命影响极大。
回流泵在对工作压力的控制上则是泵头上设一个泄压控制阀，就是在出水腔里设有一个回流孔，当出水腔的压力达到一定程度时，就会触动泄压控制阀门，使多余的药水回到进水腔内，进行泄压，从而达到保护水泵的目的。可见回流泵在你不关闭电源情况下，它的电机将一直工作着，所以回流泵在用细眼喷头作业时，一定要调节到适合的流量，不然会形成很大的动能浪费。在使用配备回流水泵的电动喷雾器时最好使用不带开关功能的手柄，停止作业时，直接关闭电源开关，这样能实现电源电量的最大化使用。