柴油机由一千多个零件组成，结构复杂，制造精度要求高。由两大机构和五个系统组成，即曲轴连杆机构、配气机构、进排气系统、燃料供给系统、润滑系统、冷却系统和启动系统。这些机构和系统中，某个零件一旦出现问题，就会导致故障产生。提高柴油机使用寿命，必须延长每个零件的工作时间，避免零件早期失效，针对影响柴油机使用可靠性的因素，应采取以下措施。
1做好磨合试运转
柴油机上有很多配合精度要求极高的动配合件，如曲轴与轴瓦、活塞与活塞销、气门与气门座、柱塞与柱塞套等。这些零件未使用前其表面会有很多加工刻痕，会破坏运动副之间的润滑油膜的形成。如果不经磨合直接重载和高速运转会造成配合件干摩擦，发生抓粘磨损。因此，为了避免柴油机各部件的早期磨损，延长使用寿命，新机、大修后的柴油机在正式投人使用前，必须经过一定的磨合试运转。磨合的主要目的在于使动配合件达到最佳的配合状态，提高柴油机的可靠性能，以适应全负荷作业。良好的磨合可以提高柴油机的动力性、经济性、工作可靠性。新机或大修后的柴油机磨合期一般为50～60h，但其磨损量却为柴油机正常磨损量的4-8倍。因此，应严格按照使用说明书规定的磨合规范进行初运转磨合。
2正确操作
操作人员要按照使用规定正确操作。如冷车启动时，最好进行预热或预先润滑，尽量减少冷启动次数。电启动装置不宜连续长时间工作。停机前，先卸去负荷降低转速，熄火应先关断油门，使残余燃料烧完而熄火。工作时保持正常的温度、转速、负荷规范，不突然提高转速，不长时间怠速运转等。若不注意正确的使用和操作，柴油机的技术状态会迅速恶化，甚至造成零部件的损坏和发生事故。
3使用中保持四净
使用中保持四净，即油净、水净、空气净、机净。根据地区、季节不同和说明书规定，选择合适牌号的机油和柴油。柴油在添加前要经48h沉淀。要定期更换机油，长期坚持使用软水，克服三漏，使机车外表干净。这里特别需要指出的是，柴油机的空气滤清器、机油滤清器和柴油滤清器（简称为三滤）。由于使用维护不当所造成的危害往往是潜在的，即三滤出了故障，常常不会立即影响发动机的运转，但实际对主要工作部件的磨损却是十分严重的。如空气滤清器的过滤效果不佳，进气管及支管等结合部，有缝隙封闭不严，进气时大量的灰尘杂质，空气中悬浮着的小颗粒直接进入气缸，加剧气缸壁与活塞环、活塞的磨损量。据有关试验证明：柴油机空气滤清器如果不起作用，进行农田作业气缸壁、活塞环、活塞的磨损量增加十倍甚至几十倍。
4遵守技术保养规程
遵守技术保养规程，保证高质量而及时的技术维护。做好日常维护工作，即使是一丝细微之处也不放过。对等级技术保养规定，应按时按质完成，决不拖延，以预防早期磨损和发生故障，保持柴油机经常处于良好的技术状态。
5定期检测
柴油机使用一段时间后，由于磨损是不可避免地发生，柴油机出厂或大修后已调好的配合间隙，又会发生变化，所以对一些重要的调整要定期检查及时调整。定期用农机检测诊断技术对柴油机进行实测，根据测得的压力、流量、温度、声响、位移、颜色等参数，对两大机构、五个系统的工作状况及技术状态作出合理分析，从而提高其使用可靠性，为掌握柴油机技术状态、排除故障提供科学依据，避免盲目拆卸和盲目修理。
6透过现象找出故障
在柴油机使用过程中，要学会透过现象发现故障。如查找柴油机功率不足故障时，可通过察看排气情况来判断。如果柴油机排气管冒黑烟，但运转平稳，说明燃油质量差，或喷油泵供油太多，或喷油时间过晚，燃烧不充分，造成发动机功率不足。如柴油机怠速或低速运转时，有较为明显的异响，故障可能是活塞销或连杆轴承装配过紧产生的声响，或活塞销、气门及气门挺柱产生的不正常的声响；如柴油机中速时存在的异响，可能是气门座圈松动产生的声响，或凸轮轴外廓磨损发出的异响。
7提高修理质量
严格按照修理规章，提高修理质量。零部件不得随意调整、改造、改装，严把配件质量关，不使用劣质配件，修后应经检验、磨合、测试功率和油耗等程序，达到质量标准方可使用。修理时要重视清洗工作，装配前首先清除机体内部的机械杂质和油泥，否则会加速零件磨损，引起油路堵塞，产生烧瓦抱轴等事故。如一般新喷油嘴偶件，外部都涂有一层防锈油，遇高温熔化后易粘住针阀。因此，更换新喷油嘴时，必须在80℃的干净柴油中清洗防锈油，并做滑动试验后再装配使用。
8妥善停放保管
要妥善停放保管机具，作业后停放应尽量入库。较长时间的停放，应进行全面保养维修，并放置在平地、干燥、通风的库内保管，防止空气、水、尘土进入重要部位。如收割机中的柴油机一年中工作十几天、二十天左右，而停放保养的时间则较长。如保管不善，则柴油机在停放期间的损坏，将远远超过工作时间的损坏。因此，保管也要得到足够的重视。