土壤的结构对于条沟的形成起着重要作用。当农机进行深翻作业时，机械设备会对土壤进行翻动和压实，这可能会破坏原有的土壤结构。土壤中的颗粒会被机械设备压实，形成大块状，使土壤的透气性和渗透性下降。而在翻动土壤的过程中，农机的施工方式和工作深度也会影响到土壤结构的破坏程度。如果操作不当，农机可能会将土壤推挤成坑坎状，导致条沟的产生。
机械操作是导致土壤出现条沟的另一个重要原因。在深翻过程中，农机的速度、转向和施工方式等因素都会对土壤产生影响。如果农机的速度过快，就会导致土壤无法充分翻动和松散，从而形成条沟。此外，农机的转向角度和施工方式也会对条沟的形成起到一定的影响。如果转向角度过大，农机的重量会集中在一个点上，造成土壤压实，难以形成均匀的结构。
环境因素也是导致条沟形成的重要原因之一。在进行深翻操作时，如果土壤含水量过高或过低，均会对土壤的结构破坏产生影响。含水量过高时，土壤会变得过于湿润，容易出现粘结，导致条沟的形成。而在干燥的环境下，土壤则会变得过于干燥，容易产生裂缝，同样会形成条沟。