柑橘溃疡病危害柑橘叶片、枝梢和果实。苗木和幼树受害特别严重会造成落叶、枯梢，影响树势；果实受害重者落果，轻者带有病疤不耐贮藏，发生腐烂，大大降低果实商品价值。
柑橘溃疡病危害叶片减少了叶片的光合作用，造成减产。
