慢性型奶牛病毒性腹泻的临床症状可以分为消化系统症状和全身症状。在消化系统方面，奶牛常常表现出食欲不振、腹泻和腹胀。牛粪呈水样或黏稠状，有时带有血液。腹胀可以导致奶牛腹部膨胀，并可能引起腹痛和不适。
全身症状包括发热、乏力和体重下降。奶牛可能会出现低热，体温轻度升高，但不超过40度。乏力是由于腹泻导致身体水分和营养的丢失，使奶牛体力逐渐下降。体重下降是由于腹泻导致食物无法充分吸收，导致奶牛无法获得足够的营养。
除了消化系统和全身症状外，慢性型奶牛病毒性腹泻还可能引起其他相关症状。奶牛可能会出现呼吸困难、鼻腔分泌物增多和咳嗽。这些症状是由于病毒感染引起的上呼吸道感染所致。此外，奶牛的乳汁质量也会受到影响，乳房可能会出现红肿、疼痛和产奶量减少等症状。