培养基制成后，由于其物理性状不同，又可分为液体培养基、固体培养基和半固体培养基。
1.液体培养基：是根据各种食用菌所需的营养成分，按一定的配比混合而成的营养液。液体培养基由于有利于食用菌菌丝细胞对营养物质的接触和吸收，因而生长繁殖快。缺点是工艺要求严格，不易掌握，生产的菌种不耐保存，易老化。
2.固体培养基：常见的固体培养基有两种，一种是在液体培养基中加入一定数量的凝固剂（多用2%琼脂）配制而成的培养基，如斜面培养基、平板培养基；另一种是在富含纤维素、木质素或固形物（木屑、棉籽壳、作物秸秆、甘蔗渣、畜禽粪等）中，加入适量的辅助营养料和水配制而成的培养基，如木屑培养基、棉籽壳培养基、粪草培养基等。
3.半固体培养基：在液体培养基料中添加少量琼脂（0.2%-0.5%)或一定数量的玉米粉、麸皮等，使之成为半固体状态的培养基，如蜜环菌的培养基。
