我国的木瓜生产多年来一直处于野生和粗放式管理状态，而导致木瓜产量极低，现就其科学管理技术介绍如下：
一、田间管理
1、保温保墒：木瓜定植后，最好随即在树盘喷洒封闭型化学除草剂，然后覆盖地膜并适时喷施适量新高脂膜保温保墒，减少除草用工，提高成活率，加快木瓜生长。在春季对树盘进行中耕、除草。
2、行间套种：木瓜定植头两年，冬季可在行间套种矮生豌豆，夏季可套黄豆、绿豆或多年生小药材。
3、施肥：
①基肥施入主要在秋季进行，幼树期也可冬季覆草（土壤封冻前进行）。秋季放基肥，其目的在于保持土壤温、湿度，使耕作层的毛细根不被冻死，同时也防止了冬旱抽条。
②追肥：一年中追肥可进行2—4次。
花前肥：可结合浇水，以追施速效氮肥为主。
壮果肥：这遍肥以氮、磷、钾三元复合肥为主，也可追施饼肥、鸡粪等。这次追肥一般在5月中、下旬进行。
采后壮树肥：果实采收后树体比较虚弱，应尽快补充各种养分。这次追肥可以是氮、磷、钾三元复合肥。
4、冬前防寒：定植头2-3年，冬前除结合追施腊肥外，喷涂护树将军可可提高木瓜的营养水平、增强植株防寒能力，促植株生长健壮，从而提高木瓜的质量产量。
二、修剪
在冬季至早春树木休眠季节进行，主要剪去枯枝、病枝、衰老枝及过密枝、使整个树型内空外圆，以利多开花、多结果。修剪后用愈伤防腐膜及时封闭剪口，消毒杀菌，防病菌侵染。若树龄衰老，需砍去老树，更新复壮。
三、花果管理
1、控梢促花新技术：可在10月下旬至11月上旬,环割涂抹叶面肥,防止冬梢抽发，储藏养料,强化树势。5月至6月,使用叶面肥,可控夏梢抽发,集中养分供应果实控冠促花。
2、保花保果：在木瓜开花前、幼果期、果实膨大期各喷1次壮果蒂灵，供给木瓜花果生长充足的营养，提高坐果率。
3、疏花疏果：疏花疏果应该从花期开始进行，可使果个匀称。根据品种果个大小和各类枝条的负载力留果和疏果，各主侧枝上尽量留枝条基部和中部的果实，树冠内部的果实因不易受风害和风磨，可以多留。留果间距，大型果20厘米左右，小型果15厘米左右。为使果实充分着色，应疏除果实附近的枝叶。
四、采收与包装
采收应于果实在树上开始变黄时进行。采收时，用手百分点掰下果实，防止机械损伤，于园内进行分类，把无病虫害、无损伤的堆在一起，进行分级。对贮存、外运、销售的果实，要分别用纸包好，放于纸箱或木箱内。观赏用的果实，约经10—20天闷贮、发汗，散放出浓香时，即可摆放室内闻香观赏。
五、病虫害防治
防治方法：
①及时把园内的枯叶、黄叶、老化叶和病叶割除，清出园外，集中烧毁，用护树将军清园，消毒杀菌，消灭菌源。
②药剂防治，喷施农药时加入适量新高脂膜，可大大提高农药有效成分的利用，药效达300%以上。
花腐病：发芽前喷布波美5度石硫合剂，展叶后、花蕾期、盛花后各喷1次波美0.4—0.5度石硫合剂。
褐斑病：发病初期叶面喷800倍70%多菌灵可湿性粉剂
铜绿金龟子：在成虫发生期，利用成虫的趋光性诱捕。成虫发生期，叶面喷1500倍50%的氧化乐果溶液。
大袋蛾：人工摘除越冬虫囊，集中烧毁。幼虫孵化期，叶面喷50%敌敌畏乳油800倍液。幼虫发生期，叶面喷杀虫剂进行生物防治。