与非茄科及十字花科蔬菜进行2年以上轮作。及时清洁田园，将病果清除带出田外烧毁或深埋。培育壮苗，适时定植，合理密植，雨季及时排水，避免下水处积水。保护地栽培要加强放风，防止棚内湿度过高。及时喷洒杀虫剂防治烟青虫等蛀果害虫。雨前雨后喷洒72%农用链霉素可溶性粉剂4000倍液，或新植霉素4000倍液，或50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液，或77%氢氧化铜可湿性微粒粉剂500倍液，或14%络氨铜水剂300倍液。防治辣椒软腐病要选择不重茬的地种植，种前用石灰消毒，降雨前后喷施农用链霉素，及时排水，发现病株要拔除。
